MongoDB是一个可移植的NoSQL数据库，它几乎可以运行在所有的操作系统之上，从而实现了跨平台性。尽管在不同的操作系统上虽然略有差别，但是从整体上来看，MongoDB在不同的操作系统平台上的体系架构（如数据逻辑结构和数据存储等等）都是一样的。一个运行着的MongoDB数据库就可以看成是一个MongoDB服务器，该服务器由MongoDB数据库实例和MongoDB数据库组成。在一般情况下，一个MongoDB数据库实例可以对应有多个MongoDB数据库，这一点与MySQL数据库类似。如下图所示。
与MySQL和Oracle等关系型数据库类似，MongoDB也是通过逻辑存储结构来管理物理存储结构。
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一、逻辑存储结构
MongoDB的逻辑存储结构是一种层次结构，主要包括了三个部分，即：数据库（Database）、集合（Collection，也可以叫做表）和文档（Document，也可以叫做记录）。MongoDB的逻辑存储结构是面向用户使用的，使用mongoshell或者应用程序操作MongoDB时，主要就是操作的MongoDB逻辑存储结构。数据库（Database）、集合（Collection）和文档（Document）的层次结构。如下图所示。
二、物理存储结构
MongoDB的默认数据目录是/daba/db，它将负责存储所有的MongoDB的数据文件。在MongoDB内部，每个数据库都包含一个.ns文件、多个数据文件和日志文件。这些文件会随着MongoDB数据量的增加变的越来越多，具体如下：
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命名空间文件
MongoDB的命名空间文件的后缀是ns，默认大小是16M。 -
数据文件：
MongoDB的数据文件后缀是0、1、2......，而.0文件16M，.1文件32M，往后则翻倍，最大值为2G，这样可以让小数据库不浪费太多的空间，大数据库能够使用磁盘上连续的空间。通过牺牲空间，换取时间。
由于从3.2版本开始，MongoDB使用了WiredTiger的存储引擎。因此无法直接在/daba/db目录下看到命名空间文件和数据文件。但使用MMAPv1的存储引擎就可以很清楚地看到这些类型的文件。
- 日志文件
MongoDB会根据不同的日志信息将日志存储在不同的位置上。下表列举了MongoDB存储日志的相关存储位置信息。
