VMD命令
少量的VMD语言积累
- 模拟盒子的显示与调控
- 出图
代码直接输入到终端的vmd运行端口。
模拟盒子的显示与调控
把模拟盒子显示出来
pbc box这时候box的低端会在你的仿真模型中心，下面我给到一个讲仿真内容置于box中心的案例代码。
pbc box-centerorigin还可以设定box的尺寸，
pbcset{100100100}-all如果模拟过程中粒子运动剧烈，为了让其不飞出盒子，可以用一下命令，确保盒子在工程中包住所有粒子，
pbc wrap-all代码直接输入到终端的vmd运行端口。