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HuProt™ 人类蛋白组芯片用于天然产物靶点发现技术研究

天然产物因其复杂的化学组成和多样化的生物活性,在药物开发和生命科学研究领域持续受到关注。随着研究需求不断提升,仅了解天然产物是否具有功能作用已经难以满足科研要求,进一步明确其直接结合蛋白和作用机制成为研究重点。因此,天然产物靶点发现技术逐渐成为天然活性分子研究的重要组成部分。

在实际研究过程中,许多天然产物表现出明显的生物学效应,但其发挥作用所依赖的分子基础仍需要进一步解析。由于天然产物可能同时调控多个蛋白以及多个信号通路,传统基于经验推测的方法可能无法全面发现潜在作用对象。因此,如何选择合适的寻找药物靶点的技术,实现天然产物单体如何锁定靶点,是科研人员需要解决的重要问题。

蛋白质微阵列技术通过建立大规模蛋白检测体系,为天然产物靶点筛选提供了新的研究方案。HuProt™20K human proteome microarray,即20K人类蛋白组芯片,通过固定大量人源蛋白,实现对小分子与蛋白相互作用关系的系统分析。

HuProt™蛋白质芯片包含超过20,000种高质量、全长重组人源蛋白,覆盖约81%的人类基因组ORF区域。这些蛋白通过真核酵母表达系统制备,相比部分传统表达方式,有助于保持蛋白质构象特点和相关生物活性,为开展直接结合检测提供支持。

依托全蛋白范围的蛋白质微阵列设计,HuProt™ 人类蛋白组芯片能够帮助科研人员开展无偏筛选。在天然产物研究中,该技术不仅可以发现主要作用蛋白,还可以获得多个候选结合对象,从而辅助构建更加完整的药物-蛋白相互作用研究体系。

HuProt™20K human proteome microarray在天然产物靶点筛选过程中,通常采用生物素标记靶点蛋白筛选方法。研究人员首先对目标天然产物单体进行生物素标记处理,再将其与芯片上的蛋白进行孵育。

当天然产物分子与某个固定蛋白产生直接结合时,芯片检测系统会产生对应信号。由于每种蛋白均以独立形式存在,检测结果能够更加清晰地体现天然产物与单一蛋白之间的物理相互作用关系。

这种Human proteome microarray assays检测模式,可以减少细胞裂解液环境中蛋白复合物以及间接调控因素的影响。因此,在开展化合物靶点鉴定、小分子药物靶点筛选以及药物筛选靶蛋白研究时,可以提供较为直接的候选信息。

在人类蛋白组芯片检测服务应用中,HuProt™20K human proteome microarray能够满足不同类型分子的靶点研究需求,包括天然产物靶点筛选、代谢物靶点筛选以及小分子(药物)靶标筛选等方向。

对于天然产物靶点鉴定技术研究而言,Huprot人类蛋白组芯片能够帮助研究人员完成从候选蛋白发现到功能确认的研究过程。通过以药找靶和靶点垂钓策略,可以减少未知机制研究中的探索成本,提高研究方向判断效率。

在实际科研应用方面,成都中医药大学团队利用20K人类蛋白组芯片开展芍药苷(PF)作用机制研究。研究团队基于芯片筛选数据发现芍药苷能够作用于PTEN参与胃黏膜修复,并围绕GSDMD相关机制进一步分析其对细胞焦亡过程的调节作用。

此外,上海中医药大学联合广州中医药大学团队利用同一次芯片筛选结果研究熊果酸(UA),发现其与DCN和SPP1两个靶点存在作用关系,并进一步揭示其在脂肪肝改善过程中的免疫和代谢调控机制。

这些研究案例体现了HuProt™20K human proteome microarray在天然产物靶点发现中的应用价值。通过蛋白质微阵列技术,科研人员可以从大规模蛋白资源中筛选潜在作用对象,为后续靶点鉴定和机制研究提供依据。

对于需要开展天然产物靶点发现技术、小分子药物靶点研究、药物-蛋白相互作用研究以及药物靶点筛选鉴定实验服务的科研团队而言,HuProt™ 人类蛋白组芯片提供了一种系统化研究路径。结合后续实验验证,可以进一步推进靶点发现、靶点鉴定和靶点研究工作。

达吉特20K人类蛋白组芯片(20K芯片)实验服务案例:

  1. Chen YJ, Shi RC, Xiang YC, et al. Malate initiates a proton-sensing pathway essential for pH regulation of inflammation.Signal Transduct Target Ther.2024;9(1):367. Published 2024 Dec 30. doi:10.1038/s41392-024-02076-9(陆军军医大学附属第一医院)IF=40.8
  2. Hu M, Xu Y, Wang Y, et al. Gut microbial-derived N-acetylmuramic acid alleviates colorectal cancer via the AKT1 pathway.Gut.Published online February 27, 2025. doi:10.1136/gutjnl-2024-332891(南方医科大学珠江医院)IF=23.1
  3. Shao M, Zhang X, Sun J, et al. Saikosaponin b1 Attenuates Liver Fibrosis by Blocking STAT3/Gli1 Interaction and Inducing Gli1 Degradation.Exploration.2766-8509.(浙江中医药大学)IF=22.5
  4. Xu Q, Li G, Zhang H, et al. The natural flavonoid dihydromyricetin targets senescent cells via PRDX2 and alleviates age-related diseases.Nat Commun.Published online March 6, 2026. doi:10.1038/s41467-026-70302-9(上海交通大学医学院)IF=15.7
  5. Chen L, Wu B, Mo L, et al. High-content screening identifies ganoderic acid A as a senotherapeutic to prevent cellular senescence and extend healthspan in preclinical models.Nat Commun.2025;16(1):2878. Published 2025 Mar 24. doi:10.1038/s41467-025-58188-5(华中科技大学同济医学院)IF=15.7
  6. Gu Y, Chen Y, Wei L, et al. Author Correction: ABHD5 inhibits YAP-induced c-Met overexpression and colon cancer cell stemness via suppressing YAP methylation.Nat Commun.2023;14(1):1875. Published 2023 Apr 4. doi:10.1038/s41467-023-37521-w(第三军医大学) IF=15.7
  7. Zhong J, He X, Gao X, et al. Hyodeoxycholic acid ameliorates nonalcoholic fatty liver disease by inhibiting RAN-mediated PPARα nucleus-cytoplasm shuttling.Nat Commun.2023;14(1):5451. Published 2023 Sep 6. doi:10.1038/s41467-023-41061-8(上海中医药大学)IF=15.7
  8. Shen SM, Ji Y, Zhang C, et al. Nuclear PTEN safeguards pre-mRNA splicing to link Golgi apparatus for its tumor suppressive role.Nat Commun.2018;9(1):2392. Published 2018 Jun 19. doi:10.1038/s41467-018-04760-1(上海交通大学)IF=15.7
  9. Li D, Wei R, Zhang X, et al. Gut commensal metabolite rhamnose promotes macrophages phagocytosis by activating SLC12A4 and protects against sepsis in mice.Acta Pharm Sin B.2024;14(7):3068-3085. doi:10.1016/j.apsb.2024.03.025(南方医科大学) IF=14.6
  10. Xu X, Yan Y, Zheng M, et al. Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10.Adv Sci (Weinh).2025 Aug 8:e17129.(首都医科大学附属北京中医医院)IF=14.1
  11. Xuan C, Chen D, Zhang S, et al. Isoquercitrin Alleviates Diabetic Nephropathy by Inhibiting STAT3 Phosphorylation and Dimerization.Adv Sci (Weinh).Published online April 4, 2025. doi:10.1002/advs.202414587(中国人民解放军总医院) IF=14.1
  12. Cui J, Chen Y, Yang Q, et al. Protosappanin A Protects DOX-Induced Myocardial Injury and Cardiac Dysfunction by Targeting ACSL4/FTH1 Axis-Dependent Ferroptosis.Adv Sci (Weinh).2024;11(34):e2310227. doi:10.1002/advs.202310227(哈尔滨医科大学附属第二医院)IF=14.1
  13. Zheng Y, Zhao L, Xiong Z, et al. Ursolic acid targets secreted phosphoprotein 1 to regulate Th17 cells against metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease.Clin Mol Hepatol.2024;30(3):449-467. doi:10.3350/cmh.2024.0047(上海中医药大学联合广州中医药大学) IF=14
  14. Zhou WJ, Yang HL, Mei J, et al. Fructose-1,6-bisphosphate prevents pregnancy loss by inducing decidual COX-2+ macrophage differentiation.Sci Adv.2022;8(8):eabj2488. doi:10.1126/sciadv.abj2488(复旦大学附属妇产科医院)IF=12.5
  15. Zhao T, Zeng J, Xu Y, et al. Chitinase-3 like-protein-1 promotes glioma progression via the NF-κB signaling pathway and tumor microenvironment reprogramming.Theranostics.2022;12(16):6989-7008. Published 2022 Oct 3. doi:10.7150/thno.75069(广州医科大学) IF=12.4
  16. Chen L, Liu DH, Li YX, et al. Akebia Saponin D Targeting Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 4 Promotes Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Deubiquitination and Activation of Brown Adipose Tissue Thermogenesis in Obesity.MedComm (2020).2025;6(11):e70420. Published 2025 Oct 15. doi:10.1002/mco2.70420(中日友好医院) IF=10.7
  17. Deng Y, Zeng L, Liu H, et al. Silibinin attenuates ferroptosis in acute kidney injury by targeting FTH1.Redox Biol.2024;77:103360. doi:10.1016/j.redox.2024.103360(南方医科大学)IF=10.7
  18. Wang G, Li X, Li N, et al. Icariin alleviates uveitis by targeting peroxiredoxin 3 to modulate retinal microglia M1/M2 phenotypic polarization.Redox Biol.2022;52:102297. doi:10.1016/j.redox.2022.102297(重庆医科大学附属第一医院)IF=10.7
  19. Cheng Y, Wang G, Yang X, et al. Artesunate alleviates Parkinson's disease by targeting astrocyte MT2A to attenuate dopamine neuronal cuproptosis.Pharmacol Res.Published online August 1, 2025. doi:10.1016/j.phrs.2025.107895(遵义医科大学) IF=10.5
http://www.jsqmd.com/news/1250742/

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