高通量基因编辑
高通量基因编辑检测主要用于CRISPR等工具的编辑效率、indel谱及脱靶效应评估，NGS（高通量测序）已成为金标准，支持批量靶点分析。武汉伯远生物 biorun.com
核心方法
NGS（扩增子/全基因组测序）：PCR扩增编辑区后测序，定量突变类型、频率及脱靶，支持深度覆盖率>1000x。
TIDE（Tracking of Indels by Decomposition）：基于Sanger测序波形分解indel比例，快速无需克隆。
T7E1酶切：杂合体特异性切割后琼脂糖电泳，估算敲除效率，但定量有限。高通量基因编辑检测 biorun.com
流程概述
提取基因组DNA，PCR扩增靶区。高通量基因编辑检测 biorun.com
纯化产物，进行NGS文库构建或Sanger测序。高通量基因编辑检测 biorun.com
数据分析：用CRISPResso或TIDE量化indel、HDR效率。高通量基因编辑检测 biorun.com
应用优势
适用于CRISPR筛选文库验证、基因治疗安全性评估及功能基因组学，支持单细胞或池式高通量，优于低通量Sanger。高通量基因编辑检测 biorun.com