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精准解码组织微环境:DSP 空间蛋白组技术,赋能疾病研究新维度

在生命科学研究向精准化、空间化迈进的今天,传统蛋白检测技术难以兼顾 “高通量” 与 “空间定位” 的核心痛点,成为解析疾病异质性、复杂免疫微环境的主要瓶颈。上海乐备实(LabEx)引入 Nanostring GeoMx DSP 空间多组学技术平台,构建了领先的空间蛋白组检测服务体系,将免疫荧光的空间优势与高通量定量技术完美融合,为科研工作者提供从组织原位到分子机制的全方位解决方案。

一、技术原理与背景:空间组学的革命性突破

随着对疾病机制的研究不断深入,仅依赖传统蛋白印迹、流式细胞术等非空间技术,已无法精准诠释组织异质性、细胞间相互作用及分子表达的区域特异性。2022 年,空间多组学技术被《Nature Methods》列为最具潜力的前沿技术,其核心价值在于实现 “分子表达 + 空间定位” 的双重解析。

LabEx DSP 空间蛋白组技术的核心原理,是将荧光标记成像与 Oligo 编码定量技术相结合:通过荧光标记抗体实现组织形态学可视化,同时利用偶联特异性 Barcode 的 Oligo 标记抗体,对目标蛋白进行精准编码。在组织切片原位完成杂交后,通过紫外光解技术释放目标区域的 Barcode 序列,经高通量测序或 nCounter 平台定量,最终实现 “空间位置 - 蛋白表达量” 的精准映射。该技术可在单个样本中同步检测 570 + 蛋白靶标,支持额外添加 40 个定制靶标,覆盖 77 条核心功能通路,全面满足复杂生物学问题的研究需求。

二、技术操作流程:标准化流程保障精准高效

DSP 空间蛋白组检测遵循严格的标准化流程,确保实验结果的可靠性与重复性,具体步骤如下:

  1. 样本制备与杂交:将 5μm 厚度的组织切片(兼容 FFPE 石蜡包埋、新鲜冻存、穿刺样本、组织阵列 TMA 等多种类型),与成像试剂(荧光标记抗体)和定量试剂(Oligo 标记抗体)混合孵育,同时完成形态学标记与分子编码。
  2. ROI 区域精准圈选:基于组织形态学特征,研究者可灵活选择任意形状、大小的感兴趣区域(ROI),包括特定细胞群、病变区域与正常组织交界区等,实现靶向性分析。
  3. Barcode 释放与收集:通过紫外光依次照射各 ROI 区域,特异性切断 Oligo 标记上的光解连接臂,在不损伤组织样本的前提下,利用微毛细管快速收集解离的 Barcode 序列,每个 ROI 对应 96 孔板中的独立孔位。
  4. 定量分析与数据输出:收集的 Barcode 序列经高通量测序或 nCounter 平台定量,结合生物信息学分析,生成包含蛋白表达量、空间分布热图、通路富集分析等多维度数据结果,支持箱型图、散点图、火山图等多种可视化展示。

三、技术优势:超越传统实验的核心竞争力

相较于 IHC、WB、流式细胞术等传统实验技术,DSP 空间蛋白组技术具备不可替代的四大核心优势:

  1. 空间与定量双重兼顾:突破传统技术 “要么有空间无定量,要么有定量无空间” 的局限,实现组织原位蛋白表达的精准定量,直接关联分子功能与组织形态。
  2. 高通量与灵活性并存:单次检测可覆盖 570 + 预设蛋白靶标,支持定制化添加靶标,同时兼容多种样本类型,无需复杂样本处理,尤其适配珍贵临床样本(如穿刺样本、FFPE 存档样本)。
  3. 靶向性与特异性突出:通过 ROI 精准圈选,可聚焦关键区域进行针对性分析,避免非目标区域的信号干扰;Oligo Barcode 编码技术确保检测特异性,有效降低交叉反应风险。
  4. 多领域适配性强:预设 Panel 覆盖肿瘤免疫、炎症调控、信号通路、细胞代谢等多个研究方向,同时支持定制化方案,满足基础研究、临床转化等不同场景需求。

四、疾病领域应用:以肿瘤科为例,赋能精准医疗研究

DSP 空间蛋白组技术在多个疾病领域均有广泛应用,其中在医院肿瘤科的研究中展现出显著价值,尤其适用于肺癌、乳腺癌、结直肠癌等恶性肿瘤的精准研究:

技术助力方向

  1. 肿瘤异质性解析:针对肿瘤组织中癌细胞、基质细胞、免疫细胞的区域分布差异,精准量化不同区域的蛋白表达谱,揭示肿瘤内部的分子异质性特征。
  2. 肿瘤免疫微环境研究:分析 CD8+ T 细胞、巨噬细胞、树突状细胞等免疫细胞在肿瘤组织中的空间分布与功能状态,量化 PD-1、PD-L1、CTLA-4 等免疫检查点分子的区域表达,为免疫治疗方案优化提供依据。
  3. 耐药机制与预后标志物筛选:对比化疗敏感区与耐药区、原发灶与转移灶的蛋白表达差异,挖掘耐药相关分子靶点及预后预测标志物,助力个体化治疗策略制定。

解决的核心难题

  1. 临床样本利用率低:传统技术需消耗大量样本进行多指标检测,而 DSP 技术可通过单张组织切片实现数百个蛋白的同步分析,极大提升珍贵临床样本的利用效率。
  2. 免疫微环境分析模糊化:传统技术无法精准区分免疫细胞与癌细胞的空间关系及功能关联,DSP 技术可明确 “哪些免疫细胞在哪个区域发挥作用”,为免疫治疗疗效预测提供直接证据。
  3. 标志物验证周期长:整合 “筛选 - 验证” 于一体,无需分阶段进行多轮实验,显著缩短肿瘤标志物的发现与验证周期,加速转化医学进程。

原文点击:精准解码组织微环境:DSP 空间蛋白组技术,赋能疾病研究新维度

http://www.jsqmd.com/news/317452/

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