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c(RGDyK);Cyclo(Arg‑Gly‑Asp‑D‑Tyr‑Lys)

一、基础结构信息

  • 名称:c(RGDyK)
  • 三字母序列:Cyclo(Arg‑Gly‑Asp‑D‑Tyr‑Lys)
  • 单字母简写:c (RGDyK)
  • 环化方式:头‑尾酰胺环化(amide cyclization)无半胱氨酸、无二硫键、无易氧化位点
  • 氨基酸长度5 个氨基酸(5‑mer)
  • 结构类型环五肽(cyclic pentapeptide)
  • 手性特征
    • Arg、Gly、Asp、Lys:L‑型
    • Tyr:D‑型(D‑Tyr),显著提升体内稳定性、抗酶解、亲和力
  • 环化位点C‑末端羧基 ↔ N‑末端氨基形成内酰胺环
  • 骨架刚性强,构象固定,完美匹配整合素结合口袋
  • 结构式

二、精确理化参数

  • 分子量:637.69 Da
  • 分子式:C27H43N9O9
  • 理论等电点 pI:9.0(弱碱性)
  • pH 7.4 净电荷:+1
  • 紫外吸收:λmax = 280 nm(来自 D‑Tyr)
  • 消光系数 ε₂₈₀1280 M⁻¹·cm⁻¹
  • 溶解性

水溶性极佳

可直接溶于水、PBS、生理盐水

高浓度仍澄清,不聚集,无需 DMSO

  • 稳定性

无 Cys、Met、Trp,氧化稳定性极高

环化结构 + D‑Tyr →极强抗蛋白酶降解

粉末 −20℃ 可稳定≥ 2 年

三、靶点与生物学机制

c (RGDyK) 是全球最经典、应用最广泛的整合素靶向肽,属于RGD 家族金标准

核心靶点

高亲和力、高选择性结合:

  • αvβ3 整合素(主要靶点,肿瘤血管高度表达)
  • αvβ5 整合素
  • α5β1 整合素

结合机制

  1. Arg 胍基:与整合素的Asp 酸性簇形成强静电作用
  2. Asp 羧基:与金属离子(Mg²⁺/Mn²⁺)配位,是RGD 必需功能基团
  3. Gly:提供柔性,使 RGD 呈现最佳结合构象
  4. D‑Tyr
  • 芳香疏水作用,增强结合能
  • 阻止氨基肽酶识别,大幅提升体内半衰期

5.Lys

  1. 调节电荷与水溶性
  2. 提供侧链氨基偶联位点(DOTA、荧光、药物、PEG)

关键生物学效应

  • 特异性靶向肿瘤新生血管
  • 抑制血管生成(拮抗整合素)
  • 抑制肿瘤细胞黏附、迁移、侵袭
  • 增强药物 / 纳米粒肿瘤富集
  • 不影响正常血管(αvβ3 低表达)

四、结构‑活性关系(SAR)关键点

1.D‑Tyr 至关重要

  • 对比 L‑Tyr:亲和力提升5–10 倍
  • 血浆稳定性提升>10 倍

2.环化构象必需

  • 线性 RGD 亲和力弱、易降解
  • 环五肽构象与整合素口袋高度互补

3.Lys 是最佳修饰位点

  • 不影响结合活性
  • 广泛用于:DOTA、NOTA、荧光素、生物素、药物偶联

4.Asp 绝对不可替换

  • 金属配位核心,缺失则完全失活

五、核心应用领域

1. 肿瘤靶向 PET 显像

  • ⁶⁸Ga‑DOTA‑c(RGDyK)
  • ⁶⁴Cu‑DOTA‑c(RGDyK)
  • 用于:
    • 肿瘤血管生成成像
    • 肿瘤分期、转移灶检测
    • 疗效早期评估

2. 荧光 / 光学成像

  • FITC、Cy5/7、IRDye800CW 偶联
  • 术中荧光导航、小动物成像

3. 靶向药物递送

  • 化疗药(多柔比星、紫杉醇)
  • 蛋白药物、抗体、siRNA
  • 脂质体、纳米粒、胶束表面修饰

4. 抗血管生成与抗肿瘤研究

  • 整合素拮抗剂
  • 抑制肿瘤生长、侵袭、转移
  • 联合放疗 / 化疗增敏

5. 基础研究

  • 整合素亲和力测定(SPR、ITC)
  • 细胞黏附、迁移、侵袭实验
  • 受体竞争性结合实验

六、实验操作指南

溶解

  • 直接用Milli‑Q 水或 1×PBS溶解
  • 浓度 ≤ 10 mg/mL 完全澄清
  • 无需助溶剂,避免 DMSO

保存

  • 粉末:−20℃ 干燥避光,可稳定 2 年以上
  • 溶液:小体积分装,−20℃ 冻存,避免反复冻融

定量

  • 280 nm 紫外直接定量(最简单准确)
  • 也可用 HPLC、BCA、氨基酸分析法

偶联

  • Lys 侧链 ε‑NH₂ 为标准偶联位点
  • 适用于:NHS 活化酯、异氰酸酯、环加成反应
http://www.jsqmd.com/news/567650/

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