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Python科研绘图实践【3】——差异检验与散点箱形图附代码

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一、主题
专注Python科研绘图,以Matplotlib、Seaborn、SciencePlots等库为核心,打造符合SCI、EI及中文核心期刊审稿标准的高质量论文图表。

二、目的
帮助各位小伙伴有效提升学术论文的图表质量,解决因图片粗糙、样式随意导致的拒稿或大修问题,用专业、清晰的可视化表达增强审稿人好感,切实增加投稿中稿率。

三、内容
基础优化:折线图、柱状图、散点图、箱线图等常用图形的期刊级美化(字体、刻度、图例、配色)。

提效技巧:LaTeX字体嵌入、矢量图导出(PDF/SVG)、多子图对齐、分辨率设置等出版规范

避坑指南:图例遮挡、颜色刺眼、缩放失真等常见拒稿问题的一键修复方案。

实战案例:每篇附可运行代码+模拟数据,对比修改前后效果,供各位小伙伴参考。


📚【本期案例】

差异检验与散点箱形图附代码👇

# 加载必要的包 library(ggpubr) library(reshape2) library(dplyr) # 读取数据 data <- read.csv("test.csv") # 将数据从宽格式转换为长格式 data_long <- melt(data, variable.name = "Group", value.name = "Value") # 设置组的顺序(对照组在前) data_long$Group <- factor(data_long$Group, levels = c("IgG", "aITGA11", "aCHI3L1", "aITGA11_aCHI3L1")) # 进行组间比较的统计检验 stat_test <- compare_means(Value ~ Group, data = data_long, ref.group = "IgG", method = "t.test") mycolor <- c("#0077c1", "#00a99e", "#6bc72b", "#ff5a20") # 绘制箱形图 p <- ggboxplot(data_long, x = "Group", y = "Value", fill = "Group", color = "Group", width = 0.45, palette = c("#0077c1", "#00a99e", "#6bc72b", "#ff5a20"), add = "jitter", add.params = list(size = 1.5, alpha = 0.7), xlab = "", ylab = "LYVE-1 positive vessel/tumor") + scale_colour_manual(values=alpha(mycolor,1))+ scale_fill_manual(values=alpha(mycolor,0.1))+ theme(legend.position = "none", axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1)) # 添加显著性标记(星号) p + stat_pvalue_manual(stat_test, label = "p.signif", y.position = max(data_long$Value) * 1.05, step.increase = 0.1) # 添加显著性标记(pvalue) p + stat_pvalue_manual(stat_test, label = "p.adj", y.position = max(data_long$Value

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http://www.jsqmd.com/news/673005/

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