人体蛋白质异构体图谱

摘要

新兴研究凸显了蛋白异构体的重要性——尽管源自同一基因，蛋白异构体通常具有独特的功能作用，且有助于生理多样性、疾病机制及表型变异的形成。然而，目前缺乏全面表征蛋白异构体的异构体水平资源。IsoProDB是个整合统一的一站式数据库，对来自RefSeq和UniProtKB的蛋白异构体进行序列比对，支持人类蛋白异构体的跨序列可视化分析。该数据库整合了多种特征信息，包括结构域架构、内在无序区域、序列变异、跨膜拓扑结构，以及来自多个资源的52种不同翻译后修饰（PTMs），并将其映射至蛋白异构体。目前，IsoProDB支持研究人员对源自20,536个蛋白编码基因的110,149个蛋白异构体，就所有整合特征进行基因水平的比较分析，并提供高效的可视化工具。这有助于深入了解保守与非保守PTM位点、结构域、异构体特异性膜定位、变异对蛋白功能的影响，以及跨蛋白异构体的疾病相关性。随着特定异构体逐渐成为多种疾病的标志物和诊疗靶点，IsoProDB已与多个全球资源整合，方便研究人员导航和探索异构体的多组学信息。

数据库URL

https://ciods.in/isoprodb

GitHub

https://github.com/sree-pathappillil/IsoProtDB

rajeshraju@yenepoya.edu.in

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材料与方法

IsoProDB的开发技术框架

图1  IsoProDB的开发所使用的方法和资