HCV Core Protein (59-68)；RGRRQPIPKA

一、基础信息

多肽名称：丙型肝炎病毒 核心蛋白片段 (59-68)
英文名称：HCV Core Protein (59-68)
三字母序列：Arg-Gly-Arg-Arg-Gln-Pro-Ile-Pro-Lys-Ala
单字母序列：RGRRQPIPKA
氨基酸数量：10 aa
结构特征：线性天然多肽；无 Cys、无二硫键、无 Met、无 Trp/Tyr；无末端乙酰化 / 酰胺化

结构式：

二、理化性质

• 分子式：C50H91N21O12
• 理论分子量：1178.41 Da
• 等电点 pI：强碱性，富含多 Arg、Lys 正电荷残基
• 紫外吸收：无 Trp、Tyr、Phe，280 nm 无紫外吸收，浓度需用 BCA / Bradford 定量
• 溶解性：高密度碱性正电荷 + Gln/Pro 极性骨架，水溶性极好，可直接溶于无菌纯水、pH7.2–7.4 PBS
• 稳定性：无 Cys、Met，无氧化、无分子间聚合，理化性质非常稳定，耐冻融、耐常温短时放置

三、序列分段解析

1. N 端碱性核心区 Arg-Gly-Arg-Arg
   连续多精氨酸富集强正电荷，是 HCV 核心蛋白核酸结合、蛋白互作、核定位关键基序；
   Gly 高柔性，维持肽链灵活构象，不阻碍静电结合。
2. 构象调控区 Gln-Pro-Ile-Pro
   Gln 极性亲水稳定构象；双 Pro 诱导肽链固定转角，形成 Core 蛋白特有空间结构；
   Ile 适度疏水支撑局部骨架，维系蛋白 - 核酸、蛋白 - 蛋白相互作用构型。
3. C 端功能收尾区 Lys-Ala
   Lys 补充正电荷，强化细胞穿透、核酸结合与免疫原性；
   Ala 小侧链封闭末端，无空间位阻，稳定整条片段二级结构。

四、生物功能与作用机理

1. 对应HCV Core 核心蛋白 59–68 保守功能域，属于病毒核衣壳蛋白关键区段；
2. 强碱性序列介导与病毒基因组 RNA 特异性结合，参与病毒核衣壳组装、包装基因组；
3. 具备核定位信号特征，调控 Core 蛋白胞内定位、细胞信号通路、细胞凋亡与脂滴结合；
4. 参与 HCV 病毒复制、脂质代谢重塑、宿主细胞周期调控，是抗病毒靶点重要区域。

五、科研应用

1. HCV 核心蛋白 RNA 结合机制、核衣壳组装机理研究；
2. 病毒核定位信号、细胞胞内转运机制实验工具肽；
3. HCV 抗原表位制备、免疫动物多抗 / 单抗制备；
4. 抗 HCV 多肽抑制剂、小分子靶向药物筛选模板；
5. 碱性多肽与核酸相互作用、蛋白构效关系研究。

六、溶解与储存建议

1. 强碱性多肽，直接用无菌超纯水或 PBS 即可快速溶解；
2. 无光敏感、无易氧化残基，常规避光密封即可，无需还原剂、无需特殊脱氧环境；
3. 冻干粉：-20℃短期保存，长期-80℃密封避光；
4. 工作液小体积分装，避免反复冻融，保持结合活性与天然构象。