卡梅德生物技术快报｜噬菌体展示多肽筛选完整实操方案｜RhE 抗原靶向肽全流程实验与量化数据

、提出问题：血型抗原多肽筛选缺乏标准化实操流程

在输血医学、母婴免疫相关分子研发实验室中，多肽靶点筛选长期存在流程不统一、阳性克隆假阳性高、验证体系缺失三大痛点。针对 RhE 抗原的预防性多肽研发需求，市面上无成套可落地的噬菌体展示多肽筛选实操规范，多数实验室仅单轮淘选导致富集效率不足，ELISA 验证标准模糊，测序后无法快速验证结合竞争性，大幅拉长研发周期。 为解决实验室实操落地难题，本研究完整落地一套适配 NEB Ph.D.-12 12 肽库的噬菌体展示多肽筛选标准化操作方案，配套完整质控数据与判定阈值。

二、分析问题：噬菌体展示多肽筛选各环节关键误差来源拆解

1. 淘选轮次误差：仅一轮生物淘选无法充分去除非特异性噬菌体，靶标结合克隆富集倍数不足，是假阳性主要诱因；本研究对比单轮、两轮淘选回收率，证实两轮是性价比最高的筛选轮次；
2. ELISA 判定标准模糊：无分层 OD 差值阈值，弱结合克隆混入测序样本，造成测序资源浪费；设置初筛 0.5、复筛 0.6 双阈值，可剔除不稳定结合噬菌体；
3. 特异性验证缺失：仅依靠测序无法证明多肽靶向抗原功能位点，必须搭配抗体竞争性实验，否则无法区分非特异性吸附多肽；
4. 试剂体系适配性：TBST 洗涤液 Tween 浓度、洗脱缓冲液 pH 值直接影响噬菌体保留，是噬菌体展示多肽筛选过程中极易忽略的变量。

三、解决问题：可直接复刻的噬菌体展示多肽筛选实操步骤

模块 1 前期试剂与耗材质控

采用 NEB 12 肽库试剂盒，RhE 合成多肽纯度＞98%，ER2738 感受态细菌、HRP 标记抗 M13 抗体配套质控，所有缓冲液现配现用。

模块 2 两轮生物淘选标准操作（噬菌体展示多肽筛选核心步骤）

1. 多肽包被：0.1mol/L NaHCO₃稀释多肽至 60μg/mL，96 孔板每孔 100μL，4℃过夜；5% 脱脂奶粉封闭；
2. 文库孵育：10 倍 TBST 稀释噬菌体文库，室温轻摇 40min，TBST 洗板 10 次洗脱游离噬菌体；
3. 酸碱洗脱中和：pH2.2 甘氨酸洗脱液回收结合噬菌体，Tris-HCl 中和后感染 ER2738 扩增；
4. 第二轮淘选扩增产物投入二次筛选，操作流程一致，最终洗脱产物直接铺板分单克隆。

模块 3 双轮 ELISA 阳性鉴定与测序流程

挑取单克隆扩增噬菌体上清，初筛、复筛两次酶标检测，达标克隆提取 ssDNA，试剂盒配套引物测序翻译氨基酸序列。

模块 4 竞争性抑制功能验证

噬菌体与 IgM 抗 - E 共孵育后结合靶多肽，OD 值下降比例作为特异性判定量化指标。

四、直观实验质控数据（实验室可直接对照参考）

1. 噬菌体滴度与富集数据：首轮投入 1.5×10¹¹ pfu，产出 6.8×10⁴ pfu；第二轮投入 1×10¹¹ pfu，产出 1.8×10⁶ pfu，富集提升 40 倍，作为实验室淘选合格判定标准；
2. ELISA 筛选统计：96 株单克隆初阳 23 株，复筛稳定阳性 13 株，测序有效 5 株，无效克隆包含测序失败、密码子不匹配两类；
3. 5 条多肽竞争抑制数据：A11、C6、D12、G7、H3 克隆加抗 - E 后 OD 降幅均＞50%，无显著差异，全部满足 RhE 表位竞争性结合要求；
4. 实操效率对比：整套噬菌体展示多肽筛选从包被到功能验证仅 6 天，较传统三轮淘选方案节约 3 天人工成本。

五、技术落地总结

本文输出的噬菌体展示多肽筛选标准化操作，可直接应用于血型抗原、膜蛋白受体等靶向多肽开发，明确了各步骤质控阈值，降低实验重复率，为中小型生物实验室输血相关多肽研发提供可落地工程方案。参考文献：覃伟，李通，田力。基于噬菌体展示技术鉴定与 RhE 抗原高亲和力的小分子多肽 [J]. 中国输血杂志，2025,38 (8):1023-1027.